老師，請問我們是醫藥連鎖公司，有25家門店，總公司是一般納稅人，20家門店是總部統一核算，增值稅企業所得稅都是總部統一申報，5家是獨立核算，增值稅跟企業所得稅門店自己申報，公司有網上銷售，開的抬頭是獨立核算的門店，但是上游公司給我們開票都是開到總公司了，獨立核算的門店沒有成本發票，我這個獨立核算的門店納稅申報應該怎么申報，賬務怎么處理？

老師，有個關于合并報表的問題。我是一個連鎖總部，一般納稅人，我的直營門店是小規模納稅人，獨立核算。 我銷售開票給門店，做的收入是不含稅的，門店收到貨入賬是含稅的，我在做合并報表的時候，這些是怎么抵消？

就是我們是藥店連鎖有限公司，下面有30家加盟店。合起來是一般納稅人，現在有10家給它分出來，作為小規模納稅人，現在就是賬務處理這方面，這10家店在總部以部門核算，每月上交營業款，減去他們店里應該承擔的費用，稅費，剩下的錢以發工資形式發給他們各門店。購買做到他們各自店里，銷售收入等全部都做到各自店里，他們付給總部加盟費。現在這家店去稅務，銀行，全部弄好了，作為小規模納稅人了，那它在總部的賬怎么處理？是得新建賬套吧，那它原來的庫存商品，房租，應收賬款，醫保欠款，怎么辦？它店還是那家店，業務庫存都不變，它只是改變核算方式

老師，我公司是連鎖企業，連鎖總部統一進貨配送至門店，總部銷售毛利為3%，總部為一般納稅人，剩余利潤都計入門店，門店全部為個體工商戶單獨核算，而且一部分門店的法人與總部法人為同一人，請問這樣的公司架構和總部毛利3%，常年虧損，有什么風險？

老師：我們公司控股了其他超市門店，這些門店就叫直營店，然后這些直營門店的收入進這個控股公司，控股公司在把這些收入轉回各個門店，然后控股公司申報收入，各門店就把貨款支付給供應商，然后供應商開票給個門店。這樣我們門店需要繳這個增值稅嗎？，我們到時候合并報表是不是門店轉出的貨款，供應商開的發票也可以算在我們控股公司，能不能算，我就問這個問題，就是供應商開給門店的發票我們控股公司可以做成本嗎？